Μία από τις πιο μεγάλες εγκληματικές οργανώσεις στην  χώρα, με ευρύ πεδίο δραστηριοτήτων στην δυτική Ιαπωνία, είναι η Yamaguchi-gumi, η οποία αποτελείται από μικρότερες συμμορίες. Πρόσφατα, η ιαπωνική αστυνομία κάλεσε τα μέλη της σε επαγρύπνηση, καθώς έγινε γνωστό ότι η μεγάλη εγκληματική οργάνωση γνώρισε ευρεία διάσπαση και 13 «θυγατρικές συμμορίες» αποχώρησαν ή εκδιώχθηκαν από την «μητρική» συμμορία, μετά από διαφωνία που είχαν σχετικά με το πώς διαχειρίζεται τα συμφέροντα της οργάνωσης στην προσοδοφόρα αγορά του Τόκιο, ο επί δέκα χρόνια «σκοτεινός» αρχηγός, ο 73χρονος Shinobu Tsukasa.

Η αστυνομία της Ιαπωνίας έχει εκφράσει την έντονη ανησυχία της ότι η διάσπαση της μεγαλύτερης εγκληματικής οργάνωσης στην χώρα θα επιφέρει συγκρούσεις βίας και αναταραχών σε όλη την χώρα και ειδικότερα, στο δυτικό τμήμα της, στο οποίο δραστηριοποιείται κυρίως η Μαφία, εξαιτίας των συμπλοκών μεταξύ των αντίπαλων ομάδων.

Το 1984 ήταν η τελευταία φορά που η εγκληματική οργάνωση Yamaguchi-gumi είχε γνωρίσει φαινόμενα διάσπασης με αποτέλεσμα να ξεσπάσουν συγκρούσεις ανάμεσα στις αντίπαλες συμμορίες με 25 νεκρούς, ένας εκ των οποίων αστυνομικός και 70 τραυματίες.

Μετά το τέλος του Β' Παγκοσμίου Πολέμου και την βαριά ήττα της Ιαπωνίας στην χώρα του Ανατέλλοντος Ηλίου δημιουργήθηκε και άπλωσε τα πλοκάμια της η Μαφία, που είναι περισσότερο γνωστή διεθνώς με το όνομα «Γιακούζα». Η Γιακούζα διαθέτει στους κόλπους της πολλές εγκληματικές οργανώσεις που δραστηριοποιούνται, κυρίως, στο εμπόριο ναρκωτικών, στην «προστασία», στην πορνεία και στα τυχερά παιχνίδια.