Η τραγωδία στο Φαρμακονήσι έχει πάρει διεθνείς διαστάσεις με την Ελλάδα να εκτίθεται τόσο σε διεθνείς οργανισμούς όσο και στην Ευρωπαϊκή Επιτροπή με τις παλλινωδίες που σημειώνονται. Το ζήτημα σύμφωνα με πληροφορίες έχει φτάσει στον Αντώνη Σαμαρά ο οποίος δεν είναι διατεθειμένος να ανεχτεί άλλο αυτήν την κατάσταση τη στιγμή που η Ελλάδα βρίσκεται στην Προεδρία της Ευρωπαϊκής Ένωσης και έχει δώσει σαφείς εντολές να βρεθεί άμεσα η άκρη στο θέμα.