Την αποκάλυψη ότι όταν ήταν υπουργός Προστασίας του Πολίτη, η ΕΥΠ εντόπισε τζιχανστιστές στην Ελλάδα έκανε ο Γιάννης Πανούσης μιλώντας στον Ελεύθερο Τύπο. Διευκρίνισε ότι η υπηρεσία πληροφοριών δεν μίλησε για θύλακες τζιχαντιστών στη χώρα μας αλλά «εντόπισε στην Ελλάδα τζιχαντιστές, οι οποίοι ήταν Ευρωπαίοι πολίτες. Δεν μπήκαν μαζί με τους μετανάστες. Μπήκαν κανονικότατα με τα διαβατήριά τους ως Ευρωπαίοι πολίτες και με το δικαίωμα ελεύθερης διακίνησης σε όλες τις χώρες της Ε.Ε.». Ο κ. Πανούσης είπε ότι αυτό αποτελεί μεγάλο πρόβλημα καθώς «επρόκειτο για Γάλλους υπηκόους και τα λοιπά». Διευκρίνισε ότι από τις ελληνικές αρχές κινήθηκαν όλες οι διαδικασίες «για να βγάλουμε τα άτομα αυτά από τη χώρα. Μέσα στα κύματα προσφύγων μπορεί να υπάρχουν τζιχαντιστές αλλά σήμερα η Ελλάδα δεν αντιμετωπίζει θέμα οργανωμένων θυλάκων μαχητών του Ισλαμικού Κράτους που μπορεί να μας απειλούν».