Η ιρανική κρατική τηλεόραση (IRIB) έκανε λόγο για «μαρτυρικό θάνατο» του Χαμενεΐ, χωρίς όμως να αποκαλύψει λεπτομέρειες για τις συνθήκες του ισραηλινού-αμερικάνικου πλήγματος. Το κρατικό πρακτορείο IRNA, πάντως, ανέφερε ότι ο Χαμενεΐ πέθανε, χωρίς να διευκρινίσει την αιτία θανάτου.

Στα μέσα κοινωνικής δικτύωσης αναρτήθηκαν βίντεο από τη στιγμή της ανεύρεσής της σορού του Χαμενεΐ, τα οποία ωστόσο δεν έχουν επιβεβαιωθεί επίσημα. Το Reuters μετέδωσε νωρίτερα ότι το Ισραήλ και οι ΗΠΑ συντόνισαν την επίθεσή τους στο Ιράν το Σάββατο ώστε να συμπέσει με συνάντηση που είχε ο ανώτατος ηγέτης της χώρας, Αλί Χαμενεΐ, με τους κορυφαίους συνεργάτες του, σύμφωνα με δύο αμερικανικές πηγές και έναν Αμερικανό αξιωματούχο που γνωρίζει την υπόθεση. Ισραηλινοί αξιωματούχοι δήλωσαν ότι ο Χαμενεΐ σκοτώθηκε μαζί με κορυφαίους συνδέσμους του, συμπεριλαμβανομένων των Αλί Σαμχάνι, ισχυρού πρώην γραμματέα του Εθνικού Συμβουλίου Ασφαλείας, και του Μοχάμαντ Πακπούρ, διοικητή των Φρουρών της Ισλαμικής Επανάστασης. Δύο ιρανικές πηγές δήλωσαν στο Reuters ότι ο Χαμενεΐ συναντούσε τον Σαμχάνι και τον Γραμματέα του Ανώτατου Εθνικού Συμβουλίου Ασφαλείας Αλί Λαρίτζανι σε ασφαλές σημείο λίγο πριν ξεκινήσουν οι επιθέσεις. Σύμφωνα με την ίδια πηγή σκοτώθηκε κατά την ισραηλινή αεροπορική επιδρομή το πρωί του Σαββάτου στο σπίτι του. Το ισραηλινό Κανάλι 12 μετέδωσε ότι κατά τη διάρκεια της κοινής επίθεσης των ΗΠΑ και του Ισραήλ κατά του Ιράν, 30 βόμβες έπεσαν στο συγκρότημα του ανώτατου ηγέτη του Ιράν. «Τριάντα βόμβες έπεσαν στο αρχηγείο.

 Ο Χαμενεΐ ήταν σε κάποιο υπόγειο» ανέφερε το κανάλι.
Μετά την επίσημη ενημέρωση από την ιρανική κυβέρνηση για τον θάνατο του Χαμενεΐ στον επίσημο λογαριασμό του στο Χ αναρτήθηκε μια φωτογραφία του να χαιρετάει με λεζάντα αραβικό εδάφιο από το Κοράνι (Σούρα Αλ-Αχζάμπ, 33:23): «Στο όνομα του Θεού, του Πολυεύσπλαχνου, του Πολυελεήμονα. Ανάμεσα στους πιστούς υπάρχουν άνδρες που τήρησαν πιστά τη διαθήκη που έκαναν με τον Θεό· από αυτούς άλλοι ολοκλήρωσαν τον όρκο τους και άλλοι αναμένουν, και δεν άλλαξαν καθόλου (τη στάση τους).»