Στην 66η θέση βρίσκεται το πανεπιστήμιο Κρήτης στην διεθνή κατάταξη του Times Higher Education (ΤΗΕ) για το 2016, ενός από τους πιο έγκυρους οργανισμούς κατάταξης, που αφορά σε πανεπιστήμια που λειτουργούν για λιγότερα από 50 χρόνια. Πρόκειται για την πέμπτη κατά σειρά χρονιά που το πανεπιστήμιο Κρήτης συγκαταλέγεται ανάμεσα στα 150 καλύτερα νέα πανεπιστήμια διεθνώς, κάτι που όπως αναφέρει σχετική ανακοίνωση του ιδρύματος, «είναι ένα επίτευγμα από μόνο του και αποκτά ιδιαίτερη αξία, με δεδομένες τις εξαιρετικά δυσμενείς συνθήκες μέσα στις οποίες λειτουργεί». 

Σημειώνεται ότι η κατάταξη «THE 150 Under 50», λειτουργεί συμπληρωματικά σε εκείνη της THE World University Rankings και χρησιμοποιεί τους ίδιους 13 δείκτες επίδοσης που καλύπτουν όλο το εύρος της αποστολής ενός πανεπιστημίου (διδασκαλία, έρευνα, μεταφορά τεχνογνωσίας και εξωστρέφεια) και δίνει λιγότερο βάρος σε υποκειμενικούς δείκτες που συνδέονται με τις κατατάξεις των γνωστών παραδοσιακών πανεπιστημίων και προκύπτουν κυρίως από τις δυνατότητες χρηματοδότησης τους και τη φήμη τους. «Η εμφάνιση του Πανεπιστημίου Κρήτης για ακόμα μια χρονιά στις κατατάξεις του ΤΗΕ αποτελεί μια ακόμα επιβράβευση για την αφοσίωση και τη σημαντική προσπάθεια των μελών της ακαδημαϊκής κοινότητας που, σε τόσο αντίξοες συνθήκες, προσπαθούν να κρατήσουν το υψηλό επίπεδο της έρευνας και της εκπαίδευσης, τομείς για τους οποίους το Πανεπιστήμιο έγινε διεθνώς γνωστό», αναφέρεται στην ανακοίνωση του πανεπιστημίου Κρήτης.